O Programa tem como principal objetivo formar profissionais do Sistema Único de Saúde - SUS, envolvidos com análise e planejamento de ações em saúde através do controle de doenças, epidemiologia e vigilância em saúde. Mais especificamente, pretende-se:

- oferecer aos técnicos locais subsídios teórico-práticos relativos às abordagens do espaço em análises de saúde para a vigilância em saúde que contribuam para o aprimoramento das práticas e ações de saúde, embasadas em noção ampliada dos processos de saúde e no uso de ferramentas tecnológicas disponíveis, incorporando avanços tecnológicos ao Sistema Único de Saúde;

- promover oportunidades de reconhecimento, análise e discussão sobre o território de atuação desses profissionais, visando à elaboração de diagnósticos da situação de saúde e das condições de vida, a identificação de situações-problema e a elaboração de propostas de intervenção;

- aperfeiçoar a capacidade de análise de sistemas nacionais de informação para a vigilância em saúde a partir de dados existentes e de informações produzidas localmente nos estados e nos municípios.

- aprimorar o uso dos programas nacionais de visualização e análise de dados espaciais para a vigilância em saúde a partir da incorporação de ferramentas que permitam e facilitem a espacialização das informações em diversas escalas de análise de recortes territoriais (estados, municípios, bairros e vizinhanças).

Os cursos visam capacitar e atualizar profissionais com nível de formação superior, técnicos atuantes na área de Vigilância em Saúde de todas as esferas de governo (federal, estadual e municipal) participantes do VIGISUS. São pré-requisitos fundamentais para participação no curso Básico que o profissional possua:

- conhecimentos de estatística básica (bioestatística) e epidemiologia, familiaridade com a utilização de banco de dados;

- conhecimento dos principais sistemas de informação da saúde;

- conhecimento de indicadores de saúde.